科隆大學成立于1388年，稍遲于布拉格大學(1348)、維也納大學(1335)和海德堡大學(1386)的建立。它是中世紀晚期德國國內成立的第四所高等學府。科隆大學成立的文件由當時佩魯吉亞教區的烏爾班六世教皇簽署。1798年，法國軍隊入侵，大學暫時被關閉了。這期間成立了科隆中心學校，舊址后來成為科隆大學校園的一部分。1879年，建立商學院的計劃被提交給市政廳審議。

　1901年，德國所獨立的商學院在科隆成立。

　1912年，又成立了地區和社會管理學院，1919年，普魯士政府批準科隆市重建科隆大學。后來，商學院和管理學院相繼加入科隆大學。1980年，萊茵師范學院科隆分校也并入大學成為它的一個專業。科隆大學在二戰中曾一度停課，教學樓也大多被戰火摧毀。為了重建校園，所有的教學樓都修葺一新，科隆大學又恢復了昔日面貌。1954年，北萊茵一威斯特法倫州開始負責科隆大學的部分科研經費-1960年起，它完全由北威州管轄。

　科隆大學600多年的歷史決定了它在各大高校中的地位和獨特的魅力。1997／1998年冬季學期，科隆大學的注冊學生人數達62 000人之多。學校先進嚴密的管理制度為整個學校的良好運作提供了基礎。學校的高領導是校長，校長每四年由校代會選舉產生，可連選連任。另外有一名專門負責學校財政預算、規劃建設等事務的總務長。校長辦公室由校長、總務長和三名副校長組成。校評議會負責學校教學和科研方面的一切事務，由校長任主席，其它成員包括，7名教授、7名系主任、2名教師代表，2名學生代表和Ⅱ名職工代表，校代會則根據校評議會的提議頒布或修改校規章制度，校長必須每年向校代會提交一份年度報告。

校代會成員包括22名教授代表，7名教師代表，7名學生代表和7名職工代表。各系每兩年在系內教授中選出系主任，負責系內事務。此外，科隆大學還設有一個顧問委員會，由他們負責磋商學校的一些原則性問題。

  由科隆市市長、科隆大學校長和總務長、科隆市行政長官、5名校董會成員、兩名市議會成員和7名系主任組成。

　科隆大學的各項教學設施十分齊全，在校師生以及校外在此進修學習人員皆可使用。校圖書館(同時也是市圖書館)是北威州大的高校圖書館，約有藏書300萬冊，尤其珍貴的是其中包括了大量的古典書籍。讀者在此可以查閱各類書籍和報刊雜志。圖書館查詢技術先進，十分便利。

　新生入校時有專人負責使新生盡快熟悉借閱方法。此外，科隆大學還有醫學中心圖書館，它對校圖書館是個很好的補充。